廣深港高鐵票價定出，香港往來福田、深圳北、虎門及廣州南站的票價，分別為八十、九十、二百一十及二百六十元，高峰期每日會有一百一十四對列車，當中三十對是來往香港至虎門及廣州南 ，八十四對是來往香港至福田及深圳北。運輸及房屋局局長陳帆為，相對於現時香港至廣州直通車需二百一十元，高鐵票價具吸引力。
有需要往返廣東的市民歡迎安排，但亦有人認為票價太貴。立法會鐵路小組委員會主席田北辰認為，票價可以吸引商務客，高鐵亦方便未來往深圳創業的港人即日往返。立法會鐵路事宜小組委員會副主席、民建聯的陳恒鑌則認為，票價吸引力不足，相信不少市民，特別是新界區居民會選擇到深圳乘坐高鐵往廣州。公民黨議員陳淑莊亦質疑票價的吸引力，要求政府盡快交代載客量估算和經濟效益等數據。