立法會補選港島區參選人、民陣副召集人區諾軒獲確認參選提名有效，另一名參選港島區補選的退休牙醫馬金泉，及新界東補選的本土派參選人劉頴匡，就被選舉主任裁定參選提名無效；香港眾志周庭因被裁定提名無效，由區諾軒代替參選，他指，今次選舉多人因政見被剝奪參選資格，國際社會對特區政府違反《政治及公民權利國際公約》表示關注，證明政權已威脅剝奪市民參選的基本權利。

選舉主任在裁決通知書，解釋裁定劉頴匡參選提名無效，是由於他過往在社交網站及接受傳媒訪問時曾表示支持香港獨立，亦曾表示新界東議席原本屬梁頌恆和梁天琦，選舉主任認為劉頴匡極不願意放棄一直清楚表明支持香港獨立的立場，故此裁定他提名無效。劉頴匡說，在去年年尾向傳媒表述不再支持港獨，但選舉主任仍無法信納他已修改立場，批評選舉主任的決定是終身剝奪他的政治權利，他會與團隊研究包括選舉呈請等行動。