衞生署指，去年接獲七十二宗有關醫療券計劃的投訴，較前年上升超過七成。署方指，過去三年接獲一百三十八宗的投訴，至今完成九十五宗投訴調查，當中有二十九宗查明屬實或部分屬實，涉及計劃的運作程序、行政及支援服務、不當申報醫療券，及收費問題等。

對於有報道指，有藥房鼓勵長者以醫療券購買海味，衞生署指會了解事件，並作出適當跟進。署方指，醫療券不可用以純粹購買物品例如藥物、奶粉、海味或其他醫療用品，但醫療券可用於由醫療服務提供者經會診後，因應長者的健康需要而在專業執業範圍內提供的治療，及療程中所提供予病人的藥物及醫療物品等。如果懷疑服務提供者涉及詐騙或專業失德行為，衞生署會轉介警方或相關專業管理委員會，例如中醫藥管理委員會跟進，並可能取消有關服務提供者參與計劃的資格。食物及衛生局長陳肇始指，若發現涉及詐騙，警方會介入。