港珠澳大橋管理局表示，大橋開通後，會有過境旅客穿梭巴士，分為港澳線和珠港線運行，兩條線路合共投放140輛巴士，大約每十分鐘一班，並逐步加密到三至五分鐘。
管理局又指，大橋會採取「三地三檢」的通關模式，並會實行廿四小時通關，其中珠海和澳門之間，會採取「合作查驗，一次放行」的新模式。在「三地三檢」之下，三地口岸由香港、珠海和澳門三地政府各自負責設立和管理，口岸設在各自屬地之內。