中共十九屆三中全會日前通過中央國家機關機構改革方案，全國港澳研究會副會長劉兆佳說，據他了解國務院機構將有相當大規模的改變，部委數目會大幅減少，當中主管台灣事務的國台辦和主管港澳事務的港澳辦，很大可能合併，改組可符合中央要求精簡架構的方針，亦更有利處理港獨台獨等威脅。
在北京出席全國政協會議的多名港區委員相信，合併對香港影響不大。政協委員唐英年說，估計是想借鑑香港和澳門的回歸經驗，有助將來和平統一，不認為目的是想一併處理台獨港獨。政協委員、民建聯主席李慧琼說，合併是有可能，亦未必與港獨台獨思潮有關，不相信是因為中央政府不重視港澳工作。