在台灣，馬英九前總統表示，六四是否平反，對兩岸關係影響至深，認為即使大陸國力日強、人民日富，但在六四未平反前，世人提到大陸，仍會想起29年前那個血腥鎮壓的夜晚。馬英九說，「二二八事件」、「白色恐怖時期」及「六四」一樣，造成無辜受害者，但台灣政府在30年前就面對歷史，承擔責任，至今仍致力尋求家屬及後人原諒，質疑大陸為何不可以。
馬英九重申，「六四不平反，統一不能談」，認為大陸面對歷史，就事論事，面對家屬，將心比心，才能夠真正拉近兩岸人民的心理距離，亦才能夠讓大陸成為世人眼中真正的大國。