立法會是以40票贊成，20票反對，1票棄權，通過一地兩檢的法案，象徵一地兩檢的「三步走」程序，走完最後一步。運輸及房屋局長陳帆表示，如果有市民就一地兩檢提出司法覆核，政府會尊重市民的法律權利，按法治精神去處理相關的訴訟。民主派會議召集人莫乃光指，法庭的裁決會成為案例，影響長遠，必須小心審視情況再決定會否提出司法覆核。
身兼一地兩檢關注組召集人的公民黨陳淑莊批評，政府是「贏了一條草案，輸了一國兩制」，日後會繼續監察高鐵通車後，一地兩檢的落實情況。建制派班長廖長江則表示，高興見到一地兩檢順利通過，強調一地兩檢有民意支持，期望高鐵通車後，一地兩檢會發揮預期中的效益。