行政長官林鄭月娥說，對於沙中綫紅磡站擴建工程的問題，港鐵工程團隊有不可推缷的責任，至於行政總裁梁國權等的管理層，在事件獲傳媒披露後亦應該發揮監督作用，確保6月15日向政府提交的報告準確無誤，因此行政總裁梁國權經已承擔責任，提出提早退休；至於港鐵董事局則遭人蒙在鼓裡，工程人員向他們講出偏差很大的資料，要全部人負責任未必很公道。
林鄭月娥說，港鐵是龐大的機構，如果主席和行政總裁全部不在，會造成很大衝擊，因此她期望港鐵主席馬時亨留下做部分善後工作。林鄭月娥說今次事件癥結，是有工程人員提供不準確資料，未必能夠說出於管治問題，但同意港鐵某程度上要檢視管治文化。