屋宇署表示，港鐵沙中綫工程項目大部分位於政府土地，不受《建築物條例》規管，但只限於涉及委任認可人士和註冊結構工程師、審批圖則、發出工程施工許可，及發出佔用許可證的程序。而建築事務監督，即屋宇署長，向港鐵發出的豁免文書，規定港鐵必須委任具備適當經驗及資格人士負責不同工作範疇，並訂立項目管理計劃，以確保工程的管理不遜於《建築物條例》的要求，當署方認為港鐵的工程實質上偏離了既定的設計及工序，可要求港鐵採取預防或補救措施，若懷疑違反《建築物條例》，會按一貫程序處理。