運輸及房屋局長陳帆指，同港鐵簽署十年期的營運協議，按目前估算，估計港鐵會向九鐵公司，10年支付約27億元的額外經營費。陳帆說，有信心高鐵開通後可以帶動跨境乘客量，高鐵票價亦有競爭力，高鐵的營運在財務上無須政府或九鐵公司補貼。
陳帆又指，為方便香港旅客購買內地段車票，西九龍總站會有五個窗口，讓香港旅客購買內地段車票。他又指，由西九龍總站開出的列車，高峰期間每日會開出114對短途列車，平日和周末分別開行70對和82對短途列車；而長途直達列車，每日開行13對。高鐵西九龍總站，每日由早上六時至晚上十二時營運，頭班車七時開出，尾班車十點五十五分抵西九龍站，口岸將於晚上十一時半關閉。