人民力量立法會議員陳志全說，高鐵香港段行駛的路段以短途車為主，質疑高鐵競爭力不大。他又擔心，九鐵好大機會要承擔乘客量不足的風險，最終都要由市民補貼；亦關注，高鐵滲水等問題是否已經處理好，是否可以確保通車安全。
議會陣線區諾軒則說，以往政府所簽署的綜合營運協議，都是立法會有份討論，包括如何攤分收支，不明白為何政府簽訂高鐵一地兩檢協議時，立法會就無機會討論，認為若果最終都要納稅人「埋單」，是不公平。