九巴代表在巴士服務獨立檢討委員會聽證會上提出，高鐵西九龍站的巴士總站沒有廁所及休息室，對規劃感到驚奇。運輸署回覆傳媒查詢時說，對九巴就西九龍站巴士總站設施作出失實陳述表示遺憾，指西九龍站巴士總站已設有一個公共洗手間，而九巴及城巴都已設置站長室及員工休息室。
運輸署與九巴及城巴較早前已安排巴士在巴士總站試行，並完成改動相關路面設施，以配合該巴士總站於本月十六日啟用。