強颱風山竹帶來風暴潮。在大澳，海水高度上漲至海圖基準面以上約3.8米，鄉事委員會主席劉焯榮認為，整體水勢比去年稍大，但永安街等防洪工程起作用，令影響減少，而棚屋等位置水位非常高，要等水位減退。有石仔埔居民指，雖然海水已湧上岸，但設置的防水板仍能擋住潮水，入水並不嚴重。
在鯉魚門，除馬環村馬背村，入村的一段海傍道都水浸及膝，居民大多已經撤離。在將軍澳，海邊的巨浪拍打上岸，多條道路被水淹浸，水深浸過車轆。柴灣亦嚴重水浸，海水倒灌上岸，小西灣運動場有大量積水。沙田城門河同樣水位上升，一度貼近行車天橋橋底，兩旁的單車徑被浸，石門的傑志足球中心被泥水淹蓋。