高鐵首日通車，不斷有預早在網上訂購高鐵車票的市民，到西九龍總站取票，取票櫃位大排長龍。港鐵臨時在靠牆位置多開一條隊，但仍未能疏導取票乘客。有港鐵職員舉起指示牌，帶領未取票乘客走特快通道入閘，進行安檢及上車。港鐵並在早上10時半起，讓在內地官方鐵路售票平台「12306」網站，購買今日11時55分或之前班次的乘客，可直接利用手機上的訂購憑證入閘，毋須換取實體票。有內地乘客指，早前等候40多分鐘都未能取票，認為站內只開放5個櫃位讓在內地網站購票的乘客取票是不足夠。亦有購買了11時10分班次車票的乘客，在10時半過後亦被港鐵職員指示到櫃位排隊取票，形容情況十分混亂。
有本地市民指，已提早一小時到車站取票及預備做安檢，但自助取票機不能識別舊回鄉卡，無法成功取票，要職員幫助。