前天文台台長林超英建議政府，人工島項目要估算未來兩世紀氣候變化，帶來包括超強颱風增多和海平面上升等風險，並由天文台做有關氣候變化的研究，1700公頃填海亦必須分階段進行。
早前指在東大嶼填海建人工島是「逆天而行」的林超英發表網誌，指政府決意把意念推到研究階段，他對人工島項目提出五項建議，包括以保守態度估算未來兩世紀氣候變化，作為排洪規劃、人工島填海地面高度和海堤高度等規劃的指導，而有關氣候變化的研究亦不可外判給工程顧問公司，指他們不是氣象專家，會犯下氣象學家看來很簡單的錯誤。