審計報告批評工業貿易署支援中小企的工作有欠妥善。中小企業信貸保證計劃獲批的申請數目不斷下跌，由2008年1381宗，下跌至去年744宗，跌幅是四成六，認為工貿署要監察，確保計劃能繼續有效協助中小企。另外，中小企業市場推廣基金的申請亦錄得下跌，累計資助的使用率偏低，4.7萬家獲批資助的企業中，只有1.4%獲批20萬元的全額資助，工貿署有需要採取補救措施。
審計署亦指，工貿署的評審委員會的管治有改善空間，委員會一共15名委員，過去五年，每年都有3至8名委員，只是出席一半或少於一半的會議環節，而委員會會議並無法定人數的規定。