港鐵完成10月16日早上「四綫故障」事件調查，指事故與四條列車綫，兩套不同供應商信號系統設備的計數器「重置安排」不同有關，不涉及信號系統更換工程和測試。港鐵成立的高級別檢討委員會，向政府提交的報告指出，其中一套系統軟件計數器在一定年期會自動重置，而另一套軟件計數器則需要人手重置，但車務和維修人員，事前不知道兩者重置安排不一致，亦不知道對行車可能構成影響，因此以往從未做過全面整體重置。報告建議，為軟件計數器定期檢查及執行維護計劃。

港鐵車務總監劉天成指，在事故中，四條綫分別延誤61至114分鐘，港鐵會當成四宗事故看待，合共撥800萬元在明年下半年以折扣方式回饋乘客。報告提到，當日事故期間曾考慮提供接駁巴士的可行性，但認為安排不可行，港鐵會在明年年中前，與運輸署檢討探討，在較長延誤或全綫只能提供有限度服務時的交通安排。