沙中綫紅磡站擴建工程再揭發有缺陷，除了月台被剪短鋼筋，同樣由禮頓負責建造的兩條連接隧道以及列車停放處，都出現施工紀錄缺失及擅改圖則的問題。政府對港鐵作為沙中綫項目管理人的表現表示遺憾，運輸及房屋局局長陳帆要求，港鐵交代詳細情況並提交建議，確認符合建造合約和結構安全。陳帆指，紅磡站工程問題肯定會影響屯馬綫開通，政府希望盡可能局部開通，已經邀請港鐵研究，但當中涉及的改動信號系統和列車調頭安排等，都需要解決。
港鐵向政府表示，約四成的檢查及測量申請表格缺失，未能提供欠缺表格工程部份的具體位置。另外，連接隧道工程有部份鋼筋接駁位置，由鋼筋搭接方式，改為螺絲帽連接，港鐵行政總裁梁國權對禮頓的處理感到失望，會保留追究權利；他指，目前未發現三處有任何結構問題，但承認港鐵在監督方面應做得更好。