衛生署前日接獲醫管局通報，指署方臨床訊息管理系統中的流感及肺炎球菌疫苗紀錄系統，出現接種紀錄不符的情況，署方已修復程式，系統已於下午三時回復運作。事件中發現47人在2018/19季度接種兩劑相同的疫苗，當中涉及21名醫管局病人，以及26名使用「疫苗資助計劃」的人士。初步調查顯示，由於傳送疫苗接種紀錄程式出現問題，引致部分人士的相關疫苗接種紀錄未能顯示，署方接到通知後即時暫停紀錄系統的運作，已聯絡受影響人士解釋及致歉。

衛生署指事件不涉及個人資料外洩，或被未經授權人士下載的風險，與電子健康紀錄互通系統，分享疫苗接種紀錄的服務亦不受影響。署方會繼續監察系統運作，避免同類型事件再次發生。涉事的紀錄系統去年八月推出，以便衛生署、醫管局和參與「疫苗資助計劃」的私家醫生，互通市民接種流感及肺炎球菌疫苗的紀錄。