港鐵凌晨表示，警方昨晚約八時五十分在葵芳站大堂與示威人士發生衝突，期間曾有人投擲雜物，並不當使用站內消防設備。警方及後進行驅散行動，據稱期間曾在站內發射橡膠子彈，由於當時站內有乘客和港鐵職員，有關事件及行動極有可能影響他們的安全，對此港鐵公司表示非常遺憾。港鐵強調，乘客和職員的安全是首要考慮，經已向警方表示非常關注。
港鐵說，車站職員當時見站內有煙，基於乘客及車站職員安全考慮，於是啟動疏散程序。同時，車務控制中心即時指示荃灣綫列車來回方向不停葵芳站，同時安排特別列車接載站內乘客離開。到睌上十時三十五分左右，車務控制中心鑑於站內所有乘客已離開車站，於是決定關閉車站，以便詳細檢查及維修站內設施，務求車站今天可提供正常車務運作。