衞生防護中心指，雖然本港整體流感活躍程度維持在低水平，但預計在開學後，學校發生流感樣疾病爆發個案可能會上升，建議家長安排子女接種流感疫苗，在踏入冬季流感季節前加強個人保護。若師生出現發燒、呼吸道病徵、腹瀉、嘔吐或皮疹等，校方應鄭重勸諭他們切勿回校，並立即求醫。
中心又說，本地手足口病活躍程度在五月開始上升，七月至八月維持在高水平，截至八月底，今年錄得402宗手足口病院舍爆發個案，較去年同期多。中心預期新學年開始後，會繼續出現手足口病爆發個案，提醒感染的兒童應留在家中，直至病癒才可回校上課。