港鐵表示，東涌綫一列列車下午五時前，在南昌站一度受到破壞，令服務受阻，其後在五點四十二分逐步回復正常。
港鐵指，有關列車下午四時五十五分，在南昌站上落客期間，有人非法闖入車尾駕駛室，將車尾的緊急落客斜道放下到路軌上，令列車服務受阻。港鐵職員需要收回斜道，並搜索是否有人闖入路軌範圍，以及檢查鐵路設施後，才能恢復服務。