在台灣，法務部發聲明，指無法理解港府指台灣派員到港押解台灣殺人案疑犯陳同佳，是極不尊重香港司法管轄權的說法。聲明指，台方基於司法主權的地位，提出派員赴港，目的是希望港府派出聯繫窗口來諮商接人接證物等事宜，以確保人犯能順利歸案，以及合法取得在港證據以完備其證據能力，並非港府所稱跨境執法。台灣警方過去有曾將潛逃台灣的殺人犯逮捕歸案，再交由香港警方帶回香港受審的司法互助案例，呼籲港府具體回應如何合法提供案件在港證據，與台方人員共商後續司法互助事宜。
台灣東森新聞引述消息指，法務部就陳同佳案成立專案組，士林地檢署一名檢察官，聯同3名警官，昨天由桃園機場搭機到香港，入境後模擬各種接觸陳同佳的方式、也希望透過非正式的台港雙邊會談，建立接觸疑犯的具體細節。