港鐵多條綫路及車站受到阻礙，其中東鐵綫火炭至大埔墟站服務暫停，紅磡至火炭站6分鐘一班車，但不停沙田站；大埔墟至羅湖站及落馬洲站，每15及20分鐘一班車。西鐵綫於中午已陸續回復正常列車服務。另外太子站已重開，觀塘綫和荃灣綫列車恢復在太子站上落客。目前仍然關閉的車站包括旺角、葵芳及西灣河。

港鐵表示，今早再被人惡意阻礙運作，有暴徒曾向東鐵綫紅磡站對開路軌，及馬鞍山綫大水坑站路軌旁投擲汽油彈。東鐵綫粉嶺站與太和站之間、沙田站與大圍站之間的路軌都被投擲物件，一列由沙田往紅磡方向的列車，撞到一架單車令單車擱在車底，列車未能移動，乘客需要步行回沙田站。港鐵強調向路軌或行駛中的列車投擲物品，事件性質十分嚴重，可以令列車出軌，造成重大傷亡，而向列車及車站投擲燃燒彈、及擅自開啟列車逃生門等，亦對乘客、港鐵員工和鐵路設施的安全構成十分嚴重的威脅，強烈讉責暴徒行為，已經就事件報警，追究涉事人士的責任。