審計署最新一份審計報告，發現生產力促進局過去5年，舉辦的培訓課程，實際收入只達目標的4成7到6成半。上年度有12個公開培訓課程收生人數，平均較預計人數少近6成，最少人報讀的課程，更加比預計低9成2。審計署又指，生產力局過去五年的顧問服務，有四分一都未能夠收回成本，總虧損達3300萬；部分應獲得寬減費用的中小企，又未獲得寬免。
在內部管治方面，審計報告指，生產力促進局的職員人數相比編制出現顯著差距，截至2019年6月底，總人數較編制少123人，較編制少近1成8人。而近5年間的職員流失率亦偏高，平均超過1成9。生產力局主席林宣武感謝審計署的意見，指報告臚列的各項建議中，多項經已付諸實行。