在台灣，三名總統候選人到不同地方出席元旦升旗禮。爭取連任的總統蔡英文在新年談話中指，大陸近年來不停文攻武嚇、介入滲透，逼迫台灣在主權上屈服讓步，認為在一國兩制下的香港，局勢不斷惡化，政府的濫權讓一國兩制信用破產，港人告訴大家一國兩制絕對不可行，強調台灣不可能接受一國兩制。蔡英文又指，《反滲透法》通過後，只會讓台灣民主自由更受保障，不會影響自由、不會侵犯人權，兩岸正常交流往來不受影響，在大陸的台商及台生等可照舊正常生活。

國民黨的韓國瑜批評，民進黨以多數暴力方式強行通過立法，指《反滲透法》是惡法，令台灣人民心生恐懼，如果他當選總統，國民黨在立法院取得過半議席，會重新檢討。親民黨的宋楚瑜指，《反滲透法》令人人自危，嚴重影響兩岸宗教、學術、經貿正常交流，向民進黨和蔡英文提出嚴正抗議。