國台辦發言人馬曉光晚上就台灣的總統大選結果發表談話，強調北京的對台大政方針明確及一貫，堅持和平統一、一國兩制基本方針，堅持一個中國原則，堅決維護國家主權和領土完整，堅決反對任何形式的台獨分裂圖謀和行徑，堅決增進台灣同胞利益福祉。馬曉光說，兩岸關係和平發展是促進兩岸共同發展、造福兩岸同胞的正確道路，需要兩岸同胞共同努力和推動。
北京環球時報發表社評，指蔡英文連任將增加台海局勢的不確定性，有可能鼓舞蔡英文和民進黨走激進路線，加劇在兩岸問題上的極端思維，社評說，“陸強台弱”的趨勢將持續下去，大陸綜合實力變得越來越強不可阻擋，認清並順應這一最大現實，是台灣和平發展的生命線，蔡英文和民進黨當局如果要把台灣帶向相反的方向，他們必將成為被兩岸社會共同唾棄，並最終受到報應的歷史罪人。