新型冠狀病毒除了經由飛沫和接觸傳播，或可能存在糞便傳播。武漢大學人民醫院和武漢病毒研究所聯合研究發現，在患者的肛門及大便樣本中，發現病毒核酸。國家衛健委高級別專家組組長鍾南山亦指，需要注意糞便傳染的可能性。
專家建議，針對患者嘔吐物、糞便等做好個人防護。輕症患者居家隔離時，要格外重視個人與家庭成員的手部衛生，盡可能避免與家庭成員共用廁所。