港鐵沙中綫項目超支大約100億元，令整體造價增至907億元，政府將向立法會申請追加撥款。當局向立法會提交文件，指港鐵原本爭取要追加122億元，當中包括13.7億元新增項目管理費，但當局認為港鐵理據不充份，拒絕將新增項目管理費納入追加撥款當中，扣減早前已經預留的備用費用，令追加撥款壓低至大約100億元，低於港鐵在2017年估算的165億元。追加撥款主要包括宋皇臺站遺蹟考古和保育工作、灣仔北工地延後交接等引致的額外開支，並不包括紅磡站等工程問題的結構檢查和加固費用。

實政圓桌田北辰指，港鐵工程總監包立聲上任以來，一直與承建商爭取減低索償額，最終壓低追加撥款，對此表示非常歡迎，並認為港鐵今次做法，令他對港鐵管理層重拾信心。他又表示，港鐵要求額外增加項目管理費，是符合合約要求，但政府未有包括在追加撥款中，港鐵可能需要召開股東大會，表決是否豁免收取新增管理費。公民黨譚文豪就批評港鐵監工不善，表明反對撥款。