運輸及房屋局表示，疫情影響機場三跑道系統工程進度，機管局正密切監察情況，會採取措施緩減影響，目前仍會維持工程的財務安排，機場建設費水平維持不變，並繼續以2022年啟用第三條跑道，2024年完成整項三跑道系統為目標。
當局回應議員就財政預算案的質詢時表示，內地生產設施在今年2月受到疫情影響而暫停，內地來港工人亦要接受強制檢疫，三跑道系統各個施工層面都受到影響，尤其是填海工程，預計疫情在不久的將來，仍會繼續影響內地填料和勞動力供應，受影響的程度要待疫情結束後，才能確定。