有報道指，在廣州的非洲人，在當局防控疫情下受到歧視，包括被房東趕走及被拒入住酒店，有人要露宿街頭等。非洲聯盟召見中國大使表達關注；多個非洲國家駐華大使，集體去信外長王毅，要求立即停止強制檢測、隔離及其他非人道對待。美國國務院批評中方排外，認為情況顯示空洞的中非關係。

在北京，外交部發言人趙立堅強調，中方不會歧視非洲兄弟，強調廣東已經梳理排查，並採取一系列新措施，相信經過中非雙方共同努力，事情將會得到妥善解決。趙立堅又批評美國，在國際社會急需團結抗疫下，妄言聳聽，挑撥是非，既不道德，更不負責任，奉勸美方將精力放在本國疫情，企圖藉機挑撥中非友好關係，不可能得逞。國家衛健委說，廣東省的措施是在國家防輸入框架下所採取的系列措施，只要在境內，無論是中國人還是外國人，都要採取檢疫等措施，一視同仁。