行政長官林鄭月娥表示，對港澳辦及中聯辦談話發出3篇新聞稿，引起混亂表示歉意。但事件不應影響及令人質疑特區政府對事件的清晰立場，亦不應被人轉移視線，淡化引起問題的核心。她指，問題核心是部份立法會議員，特別是公民黨郭榮鏗在立法會惡意拉布，罔顧公眾利益，影響立法會運作，偏離基本法下立法會履行的職責，雖然政府過往對基本法第22條及中聯辦的定位，不完全清晰一致，但現時清晰，兩辦代表中央在港的機構，有權有責監督基本法落實，批評現時討論惡意污衊中央機構在香港角色，強調中聯辦無干預香港依法自行管理的事務。
林鄭月娥表示，目前面對的問題是政治體制中，立法會內會被癱瘓，兩辦履行中央對香港監督，當然可以發言，符合憲制及特區事務的操作，任何人將中聯辦合憲合法合理，代表中央行事的言論，視為干預是別有用心。