在台灣，法務部回應人大訂立港區國安法，國際及兩岸法律司長蔡秋明指，草案列出的4類行為，包括顛覆國家政權、分裂國家、恐怖活動，以及外部勢力干預，認為條例至少會對集會自由和言論自由，都造成非常深遠的衝擊。
台灣的外交部長吳釗燮接受美國霍士新聞訪問時，批評北京趁國際社會忙於抗疫時訂立港區國安法，是企圖接管香港行政部門，違反一國兩制的承諾，擔心大陸下一步可能對台採取軍事行動，台灣會盡所能支持香港，同時爭取國際支持並鞏固國防。