日本內閣官房長官菅義偉回應有報道指，日方拒絕參與美英等國家批評中國訂立港區國安法的聯合聲明，令美英等國感到失望。他指，對外交上的溝通不便一一作答，強調美英肯定日本的做法，有關對日本失望的傳言完全不屬實，日方比其他國家更早，就中方訂立港區國安法表示深表憂慮，並已向中方直接及明確提出。
共同社早前報道，受疫情影響，國家主席習近平暫緩以國賓身份訪日，日方希望習近平最終能夠訪日，改善兩國關係，因此沒有參與聯合聲明，避免過度刺激中國。