國家疾控中心分析6月份，從北京新發地批發市場環境採集的3株病毒基因，排除北京今波疫情，是由動物病毒外溢傳染人，亦排除是今年4月前北京本地傳播病毒株，或武漢流行的病毒株導致。疾控中心指，北京本次疫情流行的新型冠狀病毒，是「L基因型歐洲家系分支Ⅰ」，毒株比當前歐洲流行同型毒株更「老」，並推測傳染模式主要為人與人之間直接接觸傳播，以及經物品表面污染的間接接觸傳播。