日本讀賣新聞報導，一旦中國全國人大常委會通過港區國安法草案，日本政府將向中方表達「遺憾」，是僅次於「譴責」的第2嚴厲外交表現。有日本政府高層官員指，日方認為港區國安法一旦通過，會動搖一國兩制的高度自治，日本大約有1400間企業進駐香港，日本也是事件中的當事方。
報道指，日本政府以往在中日釣魚島爭議等直接關乎國家利益情況時，大多數會使用「遺憾」，但對港區國安法的外國政策，使用「遺憾」一詞是十分罕見。