政府因應疫情設立的檢疫中心，至今運作超過5個月，累計超過9500人入住。有在檢疫中心醫療站工作的衛生署醫生指，不少人難以接受要入住檢疫中心，憤怒之下試過高空襲物及逃走，醫護人員需要聯同民安隊人員，照顧檢疫人士的心理需要。有民安隊人員指，會為檢疫中心內的兒童安排玩具，亦曾在檢疫中心內舉辦網上繪畫比賽，希望照顧檢疫人士的心理需要。
疫情雖然較高峰時期紓緩，但檢疫中心仍然需要運作一段時間，有衛生署醫生指，與03年沙士相比，在檢疫中心工作最大的挑戰是疫情時間長，認為長遠要設法減輕負責檢疫的醫護人員工作量，例如透過手機應用程式與檢疫人士交流，及詢問他們每天的體溫。