直資學校孔聖堂中學聘請校長的程序引起爭議，教育局表示，已收到新校長的聘任申請，正在處理中，又指學校聘任校長時必須公開、公平、公正，教育局有機制監察直資學校的服務和辦學標準，如有違規，局方必定會嚴肅跟進。
孔聖堂中學早前聘請浸會大學教育學系教學顧問楊少榮出任校長，但被質疑資歷不足和涉嫌有角色衝突。學校現任校長楊永漢在社交網站表示，招聘過程合規，讚揚楊少榮表現卓越，又指學校受到外間團體不斷攻擊，面對四方責難質詢，他感到痛心搥胸。