英國星期日泰晤士報報道，武漢病毒研究所早在2013年發現類似新型冠狀病毒的冠狀病毒樣本。報道指，科學家在2013年由雲南省一個有蝙蝠聚居的廢棄銅礦場取得病毒樣本，隨後送到武漢病毒研究所，由「沙士」類型冠狀病毒專家石正麗進行研究。報道引述一名急診室醫療主管指，有關病毒當時造成6名清理蝙蝠排泄物的人感染嚴重肺炎，其中3人不治，很大機會由蝙蝠傳播的冠狀病毒引致死亡。
石正麗在今年2月發表的一份學術文章中，指出新型冠病毒與一組2013年從雲南取得、名為RaTG13的冠狀病毒，相似度高達96.2%；報道指RaTG13幾乎可以肯定和銅礦場找到的病毒是一種。目前並沒有證據顯示新型冠狀病毒起源自武漢病毒研究所，所長王延軼5月曾表示，實驗室內並沒有RaTG13的活性樣本，因此不可能流出病毒。