教育局長楊潤雄在立法會回應質詢時，不點名批評教協將教育議題政治化，沒有從教育專業及學生福祉出發，對此感到遺憾。他表示，教育局早前以嚴重專業失德為由，取消一名小學教師註冊，得到不少市民支持，對於教育界議員葉建源形容，涉事小學的校長、副校長及相關教師亦被處分是「株連」及「連坐」，他批評這些字眼很嚴重，屬失實，強調相關人士要為自己的錯失負責，作為專業的教師，發現教材散播港獨無理由不發聲。
民主黨許智峯則質疑，涉事教師是基於政治立場而被滅聲，質疑教師日後只可以教授學生做順民。楊潤雄表示，許智峯應列舉證據，否則只屬個人猜測，強調學校可以如常討論特區政府施政、社會事件。