保就業計劃秘書處，指香港航空未有完全遵守計劃規定，要求港航退還未有用於支付僱員工資的補貼金額，或就未達承諾僱人數繳罰款。若發現涉及虛假陳述，可能會刑事檢控僱主。港航表示，已按保就業計劃要求，將全部資助用於支薪，但只能支付去年6至11月部分薪金支出。港航指資助是按員工去年1月工資的一半或上限9千元計算，因此假設員工月薪8千元，就只有4千元資助。港航又表示已向當局解釋首輪計劃承諾員工人數不足原因，政府發放第二輪資助時已扣除罰款。

早前向當局舉報港航違規的港航被裁員工關注組質疑，港航以19年僱員收入申請補貼，每名員工應獲補貼額，應達8千7百多元，但在第二輪保就業期間，有員工仍需放無薪假，不少前線員工亦只獲支7千8百元的底薪，質疑港航未有將所有補貼用於工資。關注組要求港航，向員工退還相關津貼，又要求以正常薪金向被裁員工計算遣散費，正等待公司星期二前的回覆，不排除將會以法律行動追討。