華大基因被指因為採樣不當，未能在一名感染變種病毒的菲傭檢疫期間驗出病毒。醫學會傳染病顧問委員會聯席主席曾祈殷在一個電台節目表示，大部分患者在受感染第十天之後出現抗體，推論驗出抗體的菲傭應該在酒店隔離期間受感染，若採樣機構未能驗出病毒，需調查採樣員的採樣方法是否符合水平，同時亦要增加酒店檢疫人士的檢測次數。

曾祈殷表示，接種疫苗是應對疫情的中長期策略，但仍要繼續進行檢測，避免社區爆發隱形傳播鏈，相信政府暫停委派華大基因服務流動採樣站，是要挽回市民信心。

李偉振：任何採樣方法均不是百分百準確

香港醫務化驗所總會主席李偉振在電台節目表示，不論是深喉唾液樣本抑或鼻咽拭子樣本，最多只有七成敏感度，亦未知對變種病毒的準繩度有多高，因此所有檢測都會存在誤差，有走漏個案。

對於政府決定暫停華大基因服務流動採樣站，李偉振指，有關做法是回應公眾擔憂及懷疑，是否公道要由法理情考慮。他相信早前華大基因實驗室出現交叉污染是涉及隨機性失誤，可以改善，如果因為個別人員問題而完全剔除承辦商服務是太嚴苛，又指華大基因在過去政府願檢盡檢措施及對疫情控制改善上有貢獻。