在立法會鐵路事宜小組委員會會議，政府及港鐵匯報屯馬綫開通安排，多名議員關注車費「短貴長平」問題。熱血公民鄭松泰稱，在屯馬綫決定開通前，當局已經預視車費結構有問題，不明白為何容忍並批准開通，要求運輸署保留區內原有的小巴及巴士路線，讓短途乘客有不同選擇；民建聯陳恒鑌亦批評政府沒有履行監管責任，舉例由紅磡前往顯徑的車費是9.6元，但多乘一個站至大圍，車費反而便宜3.4元，只需6.2元，令人不解及憤怒。

港鐵解釋，屯馬綫開通之後，市民可以經不同路綫到達目的地，明白某些車程車費可能較貴，港鐵需要一定時間透過票價調整機制，逐年調整不同路綫的票價，港鐵與此同時亦有提供不同的車票優惠。政府則稱，由於經濟環境變動，港鐵每年的實際票價調整都不同，難以預計港鐵需要多少時間才可以解決「短貴長平」的問題，若貿然講出一個年期，恐怕會誤導市民。