正進行地基工程的啟德發展區新急症醫院，在上星期五，熱帶風暴「獅子山」襲港期間出現沉降超標。醫管局估計，是由於附近水壓快速上升，令預先設置的臨時板樁過度移位，導致地面出現沉降，並損壞了受影響範圍內的四個監測點，觸發超逾25毫米的預設停工指標。醫管局表示，沉降只在工地範圍內發生，經全面視察後，證實鄰近公用通道、周邊設施和香港兒童醫院，並無受事件影響，亦沒有影響長遠工程，包括樁柱地基工程。
醫管局表示，已經在星期二，即颱風「圓規」吹襲前完成穩定工程，包括復修和加固臨時支撐、灌漿、復修塌陷地面和監測點等。當醫管局收到承建商的緩解措施方案及復工要求後，會嚴格審批有關復工方案，假如得到相關批准，預計可在６至８星期內恢復工程。