受嚴重水浸及山泥傾瀉影響，九巴和城巴一度有多條路線要改道，或臨時暫停服務。九巴表示，91、91M及92號線、往新界方向的班次，由晚上8時15分起陸續恢復服務；而往九龍方向班次，則由晚上8時半起恢復。至於94號線，臨時改以北潭涌為總站，來回方向均不停上窰及黃石碼頭沿途各站。HK1夜遊路線如常服務。
城巴早前指，受暴雨影響，途經石澳、赤柱、大潭、西貢等地的巴士路線，整體行車時間可能延長；最少20條路線改道，另外有2條線只提供有限度服務。觀光開篷巴士H1、H1S、H2、H3、H4，以及來往中環摩天輪及花園道的15C號線暫停服務。