《財政預算案》建議整合政府帳目以外的基金，預計可回撥約158億元到政府帳目。消息指，2008年設立的「支援四川地震災區重建工作信托基金」，由於已完成政策目標，因此會結束，剩餘大約7500萬元會回撥。
另外「香港展能精英運動員基金」和「殘疾人士藝術發展基金」由於規模較小，各涉及約2億元，將會以每年恆常撥款取代種子基金。