公務員事務局計劃在「部門首長責任制」下，訂立兩級常設調查機制。香港特區政府公務人員聯會主席李方沖認為，當局目前向立法會提交的文件，旨在處理較技術性的問題。他指，現行《公務員敍用委員會條例》，未有賦權公務員敍用委員會調查部門首長的權力，相信新訂立的《公務員敍用委員會（調查）規例》，可將權責說明得更清晰。

李方沖在本台節目指，雖然文件未有清晰說明需啟動第二級調查的例子，而部門的常任秘書長，亦不屬規管對象，但相信「敍用委員會」之上仍有其他機制，處理部門的行政制度問題。他又說，「部門首長責任制」與現有高官政治問責制，最大分別在於問責制下，可立即免除政治問責官員的職務；而公務員一旦牽涉紀律或其他問題，就要經過很多調查程序，再視乎情況決定如何懲處。

周小松：部門首長責任制反映　行政問責並非擺設

立法會公務員及資助機構員工事務委員會主席周小松表示，《公務員守則》一向列明，公務員需對工作職效問責，認為新設的制度只是將既有的基本信念制度化，更清晰說明公務員管理團隊需要「行政問責」，並列出所需步驟，同時讓市民知道，「行政問責」並非擺設，而是會實在地執行。

周小松在另一電台節目指，新制度提出交由較獨立的公務員敍用委員會，負責處理第二級調查，而非政府內部自行處理，相信能令人感覺更客觀和獨立，形容是較好的安排。