政府推行的「部門首長責任制」，若涉及嚴重系統性問題或失誤，會啟動兩級調查機制，不過監管對象不包括常任秘書長。公務員事務局局長楊何蓓茵表示，為讓兩級調查機制的本質更清晰，會把機制改名為「行政責任兩級調查機制」，調查對象涵蓋牽涉問題的所有人員，包括常任秘書長。調查由獨立的「公務員敍用委員會」進行，更有公信力。如果工作表現欠佳，後果最嚴重會被着令退休；有不當行為可由警告至革職。
楊何蓓茵在社交平台發文指，留意到社會對「責任制」有不同理解和意見，在考慮意見後再作闡釋，清晰化「責任制」概念和實際運作；又指自己明早將出席立法會會議再作解說、回應提問，未來會繼續做好解說工作。
楊何蓓茵亦解釋，設立「責任制」及兩級調查機制，目的是清晰化部門首長的責任，提升部門的工作效能，而非取代現有的工作績效問責制度。