環保團體綠色和平指，北都三寶樹濕地保育公園引入工廠式現代化養殖場後，有逾13公頃傳統魚塘濕地遭破壞。
綠色和平近半年先後發現兩幅傳統魚塘濕地，被改建為現代化養魚場及養蝦場，涉事養蝦場面積相當於13個標準足球場，被開發成多個塑膠水池，又以大型隔水黑膠布覆蓋原來的土質基底，擺放大量供電設備、淨水儀器、管道及建築廢料，部分塘壆更被大幅挖掘，鋪設膠水管及瀝青。
綠色和平指，工廠式養殖作業阻隔水體與泥土，導致濕地喪失及整體生境退化，令濕地失去原有降溫作用，破壞吸收及儲存雨水的功能，增加極端天氣下洪水泛濫風險，亦帶來環境干擾，不利生物棲息、覓食及繁殖，包括雀鳥、蜻蜓，以及全球近危歐亞水獺等，促請政府修復，防止工廠養殖模式入侵濕地，並加強濕地的法定保護地位。