環保團體綠色和平指，北部都會區三寶樹濕地保育公園引入工廠式現代化養殖場後，有逾13公頃傳統魚塘濕地遭破壞。政府回應指，高度重視自然生態和漁農業資源的保育及可持續發展，指公園定位是「生物多樣性與水產養殖和諧共存」，將分別劃為生態友善魚塘、優化淡水濕地生境及漁業優化區。

政府指出，公園第一期第一階段工程範圍的魚塘已完成清理，建造工程預計最早於本年底或明年初展開，2031年完成。過渡期間，擬議公園範圍內的用途仍受規管，針對違例發展、非法傾倒廢物及其他違例活動，相關部門會繼續依例執法及檢控，並持續加強巡查，優先處理。

綠色和平：漁護署違「保育優先」原則

綠色和平批評，漁護署、規劃署和地政總署早於年初已巡查涉事面積逾9公頃的魚塘濕地，但濕地仍被開發成13個足球場大的工廠式塑膠池，反映集體監管失效。綠色和平又指，漁護署只向有關人士建議在維持現代化養殖的前提下，盡量避免及紓減生態影響，說法本末倒置，違背「保育優先」原則。

綠色和平又認為，憑《土地（雜項條文）條例》和地契條款，無法規管工廠式現代養殖工程及設施，促請漁護署及負責建設公園的土木工程拓展署承諾，防止工廠養殖模式入侵生態敏感地，堵塞現行法規漏洞，短期內修復受影響濕地。